Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2M9

RAB3GAP2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP2Q9H2M9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RAB3GAP2Q9H2M9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RAB3GAP2Q9H2M9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RAB3GAP2Q9H2M9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RAB3GAP2Q9H2M9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
RAB3GAP2Q9H2M9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAB3GAP2Q9H2M9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAB3GAP2Q9H2M9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
RAB3GAP2Q9H2M9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RAB3GAP2Q9H2M9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RAB3GAP2Q9H2M9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RAB3GAP2Q9H2M9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAB3GAP2Q9H2M9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAB3GAP2Q9H2M9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAB3GAP2Q9H2M9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAB3GAP2Q9H2M9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAB3GAP2Q9H2M9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
RAB3GAP2Q9H2M9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RAB3GAP2Q9H2M9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAB3GAP2Q9H2M9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAB3GAP2Q9H2M9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAB3GAP2Q9H2M9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RAB3GAP2Q9H2M9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RAB3GAP2Q9H2M9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RAB3GAP2Q9H2M9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RAB3GAP2Q9H2M9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms