Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG9Q9H0W8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMG9Q9H0W8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMG9Q9H0W8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms