Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC113Q9H0I3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC113Q9H0I3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms