Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LSG1Q9H089 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LSG1Q9H089 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LSG1Q9H089 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LSG1Q9H089 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LSG1Q9H089 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms