Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM2Q9C040 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM2Q9C040 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM2Q9C040 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms