Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NMES1Q9C002 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NMES1Q9C002 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NMES1Q9C002 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NMES1Q9C002 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NMES1Q9C002 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NMES1Q9C002 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NMES1Q9C002 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NMES1Q9C002 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NMES1Q9C002 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms