Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRNKL1Q9BZJ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CRNKL1Q9BZJ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRNKL1Q9BZJ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRNKL1Q9BZJ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRNKL1Q9BZJ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRNKL1Q9BZJ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRNKL1Q9BZJ0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRNKL1Q9BZJ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRNKL1Q9BZJ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRNKL1Q9BZJ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRNKL1Q9BZJ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRNKL1Q9BZJ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRNKL1Q9BZJ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRNKL1Q9BZJ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRNKL1Q9BZJ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CRNKL1Q9BZJ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRNKL1Q9BZJ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms