Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUSAP1Q9BXS6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUSAP1Q9BXS6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUSAP1Q9BXS6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 291.5 ms