Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRA6Q9BX79 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRA6Q9BX79 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
STRA6Q9BX79 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRA6Q9BX79 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRA6Q9BX79 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
STRA6Q9BX79 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
STRA6Q9BX79 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
STRA6Q9BX79 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
STRA6Q9BX79 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRA6Q9BX79 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms