Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LSM14BQ9BX40 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LSM14BQ9BX40 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSM14BQ9BX40 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms