Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
HIRIP3Q9BW71 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
HIRIP3Q9BW71 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
HIRIP3Q9BW71 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
HIRIP3Q9BW71 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
HIRIP3Q9BW71 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
HIRIP3Q9BW71 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms