Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBB2BQ9BVA1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB2BQ9BVA1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB2BQ9BVA1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 567.7 ms