Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAMP8Q9BV40 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAMP8Q9BV40 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms