Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB6Q9BUF5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TUBB6Q9BUF5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBB6Q9BUF5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBB6Q9BUF5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB6Q9BUF5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB6Q9BUF5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB6Q9BUF5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBB6Q9BUF5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBB6Q9BUF5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms