Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUD6

SPON2, Spondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPON2Q9BUD6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPON2Q9BUD6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPON2Q9BUD6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPON2Q9BUD6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms