Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PI4K2AQ9BTU6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PI4K2AQ9BTU6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PI4K2AQ9BTU6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms