Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RIOK1Q9BRS2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RIOK1Q9BRS2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RIOK1Q9BRS2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIOK1Q9BRS2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIOK1Q9BRS2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms