Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR0

ZKSCAN3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3Q9BRR0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ZKSCAN3Q9BRR0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZKSCAN3Q9BRR0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZKSCAN3Q9BRR0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms