Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms