Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ24

ZFYVE21, Zinc finger FYVE domain-containing protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE21Q9BQ24 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZFYVE21Q9BQ24 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFYVE21Q9BQ24 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFYVE21Q9BQ24 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 411.3 ms