Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRRX2Q99811 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRRX2Q99811 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRRX2Q99811 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRRX2Q99811 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRRX2Q99811 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRX2Q99811 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRX2Q99811 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRRX2Q99811 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRRX2Q99811 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRRX2Q99811 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRRX2Q99811 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRRX2Q99811 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRRX2Q99811 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRRX2Q99811 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRRX2Q99811 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRRX2Q99811 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRRX2Q99811 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRRX2Q99811 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRRX2Q99811 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms