Protein–RNA interactions for Protein: Q99727

TIMP4, Metalloproteinase inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP4Q99727 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TIMP4Q99727 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMP4Q99727 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMP4Q99727 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms