Protein–RNA interactions for Protein: Q99576

TSC22D3, TSC22 domain family protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D3Q99576 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSC22D3Q99576 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC22D3Q99576 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC22D3Q99576 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms