Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSMD1Q99460 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSMD1Q99460 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSMD1Q99460 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSMD1Q99460 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms