Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SIN3AQ96ST3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SIN3AQ96ST3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SIN3AQ96ST3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SIN3AQ96ST3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SIN3AQ96ST3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms