Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT8L2Q96SF2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT8L2Q96SF2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT8L2Q96SF2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT8L2Q96SF2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT8L2Q96SF2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8L2Q96SF2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8L2Q96SF2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8L2Q96SF2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8L2Q96SF2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8L2Q96SF2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8L2Q96SF2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8L2Q96SF2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8L2Q96SF2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCT8L2Q96SF2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCT8L2Q96SF2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT8L2Q96SF2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCT8L2Q96SF2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8L2Q96SF2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8L2Q96SF2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT8L2Q96SF2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms