Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB3IPQ96QF0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3IPQ96QF0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms