Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF3Q96PU9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF3Q96PU9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF3Q96PU9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms