Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
INPP4AQ96PE3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
INPP4AQ96PE3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INPP4AQ96PE3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
INPP4AQ96PE3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms