Protein–RNA interactions for Protein: Q96N77

ZNF641, Zinc finger protein 641, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF641Q96N77 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF641Q96N77 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF641Q96N77 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF641Q96N77 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms