Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP57Q96MR6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CFAP57Q96MR6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CFAP57Q96MR6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms