Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF488Q96MN9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF488Q96MN9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF488Q96MN9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms