Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FGD4Q96M96 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGD4Q96M96 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FGD4Q96M96 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FGD4Q96M96 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FGD4Q96M96 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FGD4Q96M96 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FGD4Q96M96 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FGD4Q96M96 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGD4Q96M96 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FGD4Q96M96 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
FGD4Q96M96 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FGD4Q96M96 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGD4Q96M96 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FGD4Q96M96 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGD4Q96M96 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGD4Q96M96 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGD4Q96M96 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGD4Q96M96 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGD4Q96M96 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FGD4Q96M96 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FGD4Q96M96 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FGD4Q96M96 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD4Q96M96 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD4Q96M96 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FGD4Q96M96 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD4Q96M96 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGD4Q96M96 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FGD4Q96M96 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGD4Q96M96 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FGD4Q96M96 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD4Q96M96 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms