Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF4Q96M43 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF4Q96M43 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF4Q96M43 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NBPF4Q96M43 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF4Q96M43 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF4Q96M43 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF4Q96M43 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NBPF4Q96M43 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NBPF4Q96M43 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NBPF4Q96M43 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
NBPF4Q96M43 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
NBPF4Q96M43 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NBPF4Q96M43 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF4Q96M43 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF4Q96M43 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF4Q96M43 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NBPF4Q96M43 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms