Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR1

ZFR, Zinc finger RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFRQ96KR1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFRQ96KR1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZFRQ96KR1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms