Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DCHS1Q96JQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCHS1Q96JQ0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DCHS1Q96JQ0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DCHS1Q96JQ0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms