Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS50Q96JG6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS50Q96JG6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS50Q96JG6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms