Protein–RNA interactions for Protein: Q96J84

KIRREL1, Kin of IRRE-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL1Q96J84 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KIRREL1Q96J84 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KIRREL1Q96J84 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KIRREL1Q96J84 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIRREL1Q96J84 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIRREL1Q96J84 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIRREL1Q96J84 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KIRREL1Q96J84 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms