Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCC12Q96J65 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCC12Q96J65 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ABCC12Q96J65 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms