Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHDQ96IW2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHDQ96IW2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHDQ96IW2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHDQ96IW2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms