Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC97Q96F63 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC97Q96F63 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC97Q96F63 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms