Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHFRQ96EP1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHFRQ96EP1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHFRQ96EP1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHFRQ96EP1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms