Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG4CQ96DT6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ATG4CQ96DT6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATG4CQ96DT6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATG4CQ96DT6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATG4CQ96DT6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATG4CQ96DT6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG4CQ96DT6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG4CQ96DT6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATG4CQ96DT6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG4CQ96DT6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG4CQ96DT6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG4CQ96DT6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATG4CQ96DT6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG4CQ96DT6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG4CQ96DT6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG4CQ96DT6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG4CQ96DT6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATG4CQ96DT6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms