Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A6EQ96DS6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A6EQ96DS6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms