Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C18orf8Q96DM3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C18orf8Q96DM3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
C18orf8Q96DM3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C18orf8Q96DM3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms