Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXPE2Q96DL1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NXPE2Q96DL1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXPE2Q96DL1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXPE2Q96DL1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms