Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRAMD1AQ96CP6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1AQ96CP6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRAMD1AQ96CP6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms