Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ULK4Q96C45 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ULK4Q96C45 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ULK4Q96C45 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.4 ms