Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT1

C3orf49, Putative uncharacterized protein C3orf49, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf49Q96BT1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf49Q96BT1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf49Q96BT1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C3orf49Q96BT1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms