Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN23Q96B33 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN23Q96B33 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN23Q96B33 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN23Q96B33 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms